60~70年代期间,革兰阴性杆菌是医院感染最为重要和常见的致病菌。90年代以来,革兰阳性球菌的感染发生率逐渐上升,在ICU中甚至高达50%以上。从世界范围看,当前最主要的致病菌是革兰阳性球菌(包括凝固酶阴性葡萄球菌、金黄色葡萄球菌以及肠球菌等),某些少见的革兰阴性杆菌(嗜麦芽黄单胞菌)和真菌。美国的资料表明,在血行性感染的致病菌中,革兰阳性球菌的比例更高达63%。EPIC的资料显示,金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌、凝固酶阴性葡萄球菌、念珠菌、大肠杆菌、肠球菌、不动杆菌、克雷白杆菌、链球菌和肠杆菌是最为常见的致病菌。北京协和医院ICU的统计也显示,1989年至1994年间危重病患者医院感染的致病菌中,革兰阳性球菌的比例已从16%上升至33%

除致病菌种类的变化外,致病菌的另一个重要变化趋势即耐药菌株尤其是多重耐药菌株普遍出现(表12)。此外,耐青霉素的肺炎链球菌、鲍曼不动杆菌、凝固酶阴性葡萄球菌和嗜麦芽黄单胞菌等也是常见的耐药菌。北京协和医院ICU的资料表明,近6年来危重病患者医院感染的主要致病菌为绿脓杆菌、不动杆菌、耐苯唑青霉素的金黄色葡萄球菌(MRSA)、耐苯唑青霉素的表皮葡萄球菌(MRSE)及耐万古霉素的肠球菌等,药敏结果均显示其多重耐药性。其中,嗜麦芽黄单胞菌、MRSA、MRSE肠球菌检出率的增加最为显著。