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新一代DNA测序技术助力癌症抗原筛查

2013-06-27 11:00 阅读:1717 来源:生物360 作者:网* 责任编辑:网络
[导读]日前,美国国家癌症研究所等机构的科学家们开发出了一种新的流线化方法,可快速鉴别出黑色素瘤中可被肿瘤浸润淋巴细胞识别的独特突变抗原。过去的研究证实肿瘤浸润淋巴细胞能够减少癌症病变,这些独特的蛋白小片段是肿瘤浸润淋巴细胞的识别靶标。

日前,美国国家癌症研究所等机构的科学家们开发出了一种新的流线化方法,可快速鉴别出黑色素瘤中可被肿瘤浸润淋巴细胞识别的独特突变抗原。过去的研究证实肿瘤浸润淋巴细胞能够减少癌症病变,这些独特的蛋白小片段是肿瘤浸润淋巴细胞的识别靶标。


此前的一项 2 期临床试验显示,70% 的黑色素瘤患者接受自体肿瘤浸润淋巴细胞治疗,可导致转移病灶显著消退。

在这项最新研究中,科学家对患者过继转移了自身的免疫细胞,近 40% 的患者在至少 5 年的时间内肿瘤完全消退。为了更好地了解它的作用机制,研究人员开发了一种新方法,有助于更快地筛查出这些肿瘤浸润淋巴细胞识别的突变抗原。

肿瘤浸润淋巴细胞是指那些离开血流进入到肿瘤中的白细胞。当存在大量的肿瘤浸润淋巴细胞时,表明机体启动了对抗肿瘤的免疫反应。在许多的癌症中,研究人员均开展了相关的研究,定量这些肿瘤浸润细胞,并将其数量与肿瘤特征和结果关联起来。

研究人员认为,更好地了解肿瘤浸润淋巴细胞诱导癌细胞消退的机制,将提高患者自体移植细胞治疗的效力,并且有可能揭示出肿瘤生长新机制。

研究人员指出,新技术能够更快、更容易地鉴别出免疫系统T细胞识别的突变基因抗原。从前,研究人员都是通过生成以及费力地筛查来自肿瘤的DNA库,来完成这样的工作。这一新筛查技术有可能还适用于在许多癌症类型中鉴别突变抗原。

新方法采用了新一代 DNA 测序技术,挖掘全外显子序列数据,鉴别在患者中表达的突变蛋白。随后研究人员合成出候选的突变T细胞抗原表位,并用一种主要组织相容性复合物结合算法对候 选表位进行了评估。利用这种方法,研究人员鉴别出了在患者肿瘤细胞上表达,能被肿瘤浸润淋巴细胞识别的突变抗原。


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