一项小规模研究显示，除了导致龋齿之外，口腔微生物还可能与医疗相关性肺炎风险有关。耶鲁大学感染性疾病部的Samit Joshi博士及其同事发现，ICU中的插管患者的口腔微生物特征与非肺炎患者有显著差异，健康的社区成年居民的口腔微生物特征与肺炎高危者（包括住在护理站的患者和机械通气患者）也有明显不同。

研究者招募了19名健康的社区成年居民（平均年龄60.1岁）、10名住在护理站的患者（平均年龄86.2岁，平均住护理站33.2个月）和8例接受机械通气的ICU患者（平均年龄51.6岁，平均住ICU 3.6 d），获取其口腔拭子标本。从上腭、颊黏膜、舌头和齿龈缝采集细菌样本，然后进行165核糖体RNA焦磷酸测序。该技术适用于复杂微生物分析，当尚未用于床旁或点护理分析。

研究者发现，三组受试者的口腔定殖菌均以链球菌为主，但具体比例有明显差异：社区居民为65%，护理站患者为43%，ICU患者为33%。8例ICU患者中，3例在住ICU约1周时发生肺炎。这3例患者的口腔链球菌所占比例显著低于未发生肺炎的ICU患者（0.07% vs. 49%）。

研究者继而观察了平均加权UniFrac距离，后者可对不同微生物群落进行系统性比较。结果显示，发生肺炎和未发生肺炎的ICU患者的平均加权UniFrac距离有显著差异。

研究者认为，上述结果提示，对口腔微生物进行基因测序或许能为寻找肺炎预防靶点提供新的方法。将来或许能通过保持口腔细菌群落结构和维持局部免疫防御功能而有效预防肺炎。

斯坦福大学医学教授David Relman博士认为研究者的这一想法“激动人心”。“目前需要确定的是，口腔细菌改变与肺炎风险是否存在因果关系。但无论如何，加深对这种新的肺炎标志物的了解都是十分有意义的。”